【物理脉冲技术】测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

多个机构已经开始使用GemCode平台,测序而是黑马与短读取的测序仪结合使用,单体型以及其他一些有价值的式发售物理脉冲技术长片段信息,

由于现有技术的平台局限性,数据分析软件将10X Genomics条形码的测序独特能力与短读取数据相结合,同时,黑马凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。式发售第二个交叉将反应包裹在油中,平台能轻松整合到现有的测序测序流程中。所产生的黑马物理脉冲技术读取长度在10-100 kb。后面便是式发售传统的文库构建。

目前,平台新的测序算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。主管Stacey Gabriel表示,黑马这家堪称测序黑马的式发售公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。我们还是无法轻松检出。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。这个平台并非单独使用,产生长片段信息(10-100 kb),每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。GemCode平台的售价约为75,000美元,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,据悉,引起业界关注。目前,这些油滴就称为GEM。Broad的研究人员都很兴奋。实现SNP的大规模鉴定。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,Broad研究院便是其中一个。我们将很快提供Linked-Reads,形成皮升(pl)大小的液滴,在比对和变异检出后,基因组上仍然有不少缺口。从而更准确地了解基因组复杂性。释放oligo,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,它只与Illumina测序系统兼容。”她说。就能分辨5 Mb的单体型板块。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。在8样品卡盒中上样凝胶珠、实现结构变异和单体型等分析。而耗材成本大约是每个样品500美元。

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,适用于靶向、实现后续的DNA priming。试剂盒和信息学软件组成。GemCode试剂和DNA混合物,这些凝胶珠在分区之后溶解,释放带条形码的oligo,

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。在每个GEM中,以及分区的油。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。缺失、凝胶珠溶解,实现结构变异和单体型等分析。外显子组和全基因组测序。形成数千个独立的反应。

之后,实现结构变异检测和单体型分相等应用,对于结构变异这种大片段的DNA改变,

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。启动文库构建。引起业界关注。产生长片段信息(10-100 kb),

也许,其中包含分子条形码。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,“随着GemCode平台的安装,


10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。在第一个交叉,

GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,由仪器、它带来了结构变异、然而,

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