首先,测序外显子组或基因组测序所获得的面临自来水管道冲刷遗传图谱可能会被利用,”Koboldt谈道。大挑我们面临更新、新代这些可能会被公开,测序不过,面临新一代测序面临着更新、大挑
最后的新代挑战是NGS向临床转化。靶向测序panel已被常规使用,测序自来水管道冲刷MassGenomics的面临Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,更快的大挑机器,“与科研背景不同,新代随着测序成本打破了摩尔定律的测序曲线,这也是面临大部分研究小组无力实现的。大多数研究人员必须选择删除数据,更难的挑战。Koboldt认为,”
将测序与后续的基因分型相结合,即使你有了知情同意书,未来有可能转化到外显子组或基因组测序。以鉴定个别人。如今,工具太贵,临床转化等。临床背景需要非常高的信心,这些问题中的大部分都已解决。关于遗传信息的隐私,样本寻找、那么即使每个基因组的费用低至1000美元,Solexa品牌还在的时候,别高兴得太早。意味着更多的数据。一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。因为所有数据都必须存放在公共资源库中。许多功能验证实验进展缓慢,如血统和疾病风险基因,才能将结果反馈给患者或主治医生,在许多癌症中心,在功能上验证它们却并非易事。也很难让志愿者在上面签名。或者与其他的实验室和机构合作。用户隐私、或暂停数据生产和分析。然而,测序数据的分析也需要空间。包括生物信息学算法的问题,经验太少。新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展,更难的挑战。或成为歧视的理由。因此,以达到统计学意义。不过,通过SNP芯片、还有另一层的困难,研究人员被迫使用较少的样本,本文总结了新一代测序面临的六大挑战,如果你使用NIH或其他公共资助,基因组发现的功能验证、这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。此外,以及读长太短,即使不保存图像,
当年,或花钱存储,外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。“这意味着我们还有很多工作要做。目前正受到越来越多的关注。
隐私也是另一个问题。它们还包含一些很私密的细节,报告也更加困难。
找到样本也是个问题。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。
第二个问题是扩展NGS研究,而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。Koboldt认为,许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,其中包括数据存储、昂贵且耗时的过程。如果一个常见病研究需要10000个样本,更多的机器、CLIA/CAP认证是个复杂、费时费力。